SQL 20250706

import%20marimo%0A%0A__generated_with%20%3D%20%220.17.6%22%0Aapp%20%3D%20marimo.App()%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20import%20marimo%20as%20mo%0A%20%20%20%20return%20(mo%2C)%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20nav_menu%20%3D%20mo.nav_menu(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%2Findex.html%22%3A%20f%22%7Bmo.icon('lucide%3Ahome')%7D%20Home%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%2Fnotebooks%2FSQL_20250705.html%22%3A%20f%22%7Bmo.icon('lucide%3Aarrow-big-left')%7D%20Last%20Day%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%2Fnotebooks%2FSQL_20250707.html%22%3A%20f%22%7Bmo.icon('lucide%3Aarrow-big-right')%7D%20Next%20Day%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20orientation%3D%22horizontal%22%2C%0A%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20nav_menu%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%23%20Problem%2015%3A%20Condition%20Clashes%20%E2%80%94%20Overlapping%20Trials%20with%20the%20Same%20Condition%0A%0A%20%20%20%20Goal%3A%20Identify%20pairs%20of%20trials%20that%20study%20the%20same%20condition%20and%20have%20overlapping%20start%2Fend%20dates.%0A%0A%20%20%20%20Requirements%3A%0A%0A%20%20%20%20-%20Use%20the%20AACT%20database.%0A%20%20%20%20-%20For%20each%20pair%20of%20trials%20(A%2C%20B)%2C%20find%20those%20that%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20-%20Share%20at%20least%20one%20condition%20name.%0A%20%20%20%20%20%20%20%20-%20Have%20overlapping%20time%20windows%2C%20where%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20-%20A.start_date%20%3C%3D%20B.completion_date%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20-%20B.start_date%20%3C%3D%20A.completion_date%0A%20%20%20%20%20%20%20%20-%20A.nct_id%20%3C%20B.nct_id%20(to%20avoid%20duplicates%20and%20self-pairs).%0A%20%20%20%20-%20Output%3A%20nct_id_A%2C%20nct_id_B%2C%20shared_condition%2C%20A.start_date%2C%20A.completion_date%2C%20B.start_date%2C%20B.completion_date%0A%20%20%20%20-%20Only%20include%20pairs%20where%20both%20trials%20have%20non-null%20start%20and%20completion%20dates.%0A%20%20%20%20-%20Order%20by%20shared_condition%2C%20nct_id_A%2C%20nct_id_B.%0A%20%20%20%20-%20Limit%20to%20the%20first%20100%20rows.%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20WITH%20trial_with_condition%20AS%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20SELECT%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20nct_id%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20start_date%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20completion_date%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20TRIM(INITCAP(conditions.name))%20AS%20condition%0A%20%20%20%20%20%20%20%20FROM%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20studies%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20JOIN%20conditions%20USING(nct_id)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20WHERE%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20start_date%20IS%20NOT%20NULL%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20AND%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20completion_date%20IS%20NOT%20NULL%0A%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20SELECT%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.nct_id%20AS%20nct_id_A%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t2.nct_id%20AS%20nct_id_B%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.condition%20AS%20shared_condition%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.start_date%20AS%20start_date_A%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.completion_date%20AS%20completion_date_A%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t2.start_date%20AS%20start_date_B%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t2.completion_date%20AS%20completion_date_B%0A%20%20%20%20FROM%0A%20%20%20%20%20%20%20%20trial_with_condition%20t1%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20JOIN%20trial_with_condition%20t2%20ON%20t1.condition%20%3D%20t2.condition%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20AND%20(t2.start_date%20BETWEEN%20t1.start_date%20AND%20t1.completion_date)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20AND%20t1.nct_id%20!%3D%20t2.nct_id%0A%20%20%20%20ORDER%20BY%0A%20%20%20%20%20%20%20%203%0A%20%20%20%20LIMIT%0A%20%20%20%20%20%20%20%20100%3B%0A%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%23%20Problem%2016%3A%20Multi-Sponsor%20Conflicts%20of%20Interest%0A%0A%20%20%20%20Goal%3A%20Identify%20trials%20that%20are%20potentially%20subject%20to%20conflict%20of%20interest%20by%20having%3A%0A%0A%20%20%20%20-%20At%20least%203%20different%20lead%20sponsors%20across%20all%20trials%20that%20studied%20the%20*same%20condition*%20within%20a%202-year%20window.%0A%0A%20%20%20%20Requirements%3A%0A%0A%20%20%20%20-%20Use%20the%20AACT%20database.%0A%20%20%20%20-%20For%20each%20condition%20name%2C%20look%20for%202-year%20periods%20(rolling%20or%20fixed%20window%2C%20your%20choice)%20during%20which%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20-%20At%20least%203%20distinct%20trials%20studied%20that%20condition%0A%20%20%20%20%20%20%20%20-%20And%20those%203%20trials%20had%203%20**different%20lead%20sponsors**%0A%20%20%20%20-%20Output%3A%20condition_name%2C%20window_start%2C%20window_end%2C%20sponsor_count%2C%20trial_count%0A%20%20%20%20-%20Only%20include%20rows%20where%20sponsor_count%20%E2%89%A5%203%0A%20%20%20%20-%20Order%20by%20sponsor_count%20DESC%2C%20then%20condition_name%0A%20%20%20%20-%20Limit%2050%20rows%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20WITH%20trial_with_condition%20AS%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20SELECT%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20nct_id%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20start_date%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20completion_date%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20TRIM(INITCAP(conditions.name))%20AS%20condition%0A%20%20%20%20%20%20%20%20FROM%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20studies%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20JOIN%20conditions%20USING(nct_id)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20WHERE%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20start_date%20IS%20NOT%20NULL%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20AND%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20completion_date%20IS%20NOT%20NULL%0A%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20SELECT%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.nct_id%20AS%20nct_id_A%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t2.nct_id%20AS%20nct_id_B%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.condition%20AS%20shared_condition%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.start_date%20AS%20start_date_A%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t1.completion_date%20AS%20completion_date_A%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t2.start_date%20AS%20start_date_B%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20t2.completion_date%20AS%20completion_date_B%0A%20%20%20%20FROM%0A%20%20%20%20%20%20%20%20trial_with_condition%20t1%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20JOIN%20trial_with_condition%20t2%20ON%20t1.condition%20%3D%20t2.condition%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20AND%20(t2.start_date%20BETWEEN%20t1.start_date%20AND%20t1.completion_date)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20AND%20t1.nct_id%20!%3D%20t2.nct_id%0A%20%20%20%20ORDER%20BY%0A%20%20%20%20%20%20%20%203%0A%20%20%20%20LIMIT%0A%20%20%20%20%20%20%20%20100%3B%0A%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0Aif%20__name__%20%3D%3D%20%22__main__%22%3A%0A%20%20%20%20app.run()%0A